Det sade finansminister Magdalena Andersson vid en pressträff på torsdagen.
Bakgrunden är att Ingemar Hansson har agerat ombud åt en vän som inte ville betala en privat skuld.
Under 2016 avslöjade dessutom SVT:s Uppdrag granskning att Ingemar Hansson och Skatteverkets överdirektör Helena Dyrssen försökt varna den tidigare kollegan Frank Belfrage för att journalister begärt ut skatteuppgifter.
Magdalena Andersson sade att Skatteverket är en av de mest grundläggande myndigheterna och bas för välfärden. Det har även stora befogenheter att ingripa i enskilda människors liv.