Topix-index och Nikkei 225-index föll cirka 5,5 procent vardera.
"Vi har haft en bubbla vad gäller människors förväntningar på centralbankernas makt. Och nu ser vi den bubblan spricka. Investerare börjar nu att prisa in att centralbankerna inte längre kan kontrollera marknaderna. Det blir uppenbart efter Bank of Japans senaste stimulans, och nu verkare liknande uppfattning stärkas om ECB", säger Soichiro Monji, chefstrateg på Daiwa SB Investment i Tokyo.
Bank och finans var en av de mest pressade sektorerna i Tokyo.
